Ex3.1 VASP输出文件的基本概念
上一节,我们介绍了VASP任务的的提交,不出意外,会看到一堆的输出文件。由于大家还处在一个刚刚接触VASP的阶段。我们先根据目前的计算,挑容易的,重要的进行介绍。本节我们主要简单描述下VASP的输出,让大家有一个初步的印象,不至于看到一堆的文件手忙脚乱。以下是一些基本的建议或者学习的思路。
1)VASP的输出结果包括:电子结构,几何结构这两个主要的内容。那些乱七八糟的输出文件无非就是变着法的去描述电子和几何结构,有些是记录计算过程的一些文件。
2) 了解输出文件首先去看官网:https://www.vasp.at/wiki/index.php/Category:Output_files
3)了解输出文件可以结合自己的操作例子,挨个去接触,这是最有效的办法,因为你根本避不开这一步。
4)很多的输出文件等你毕业了也用不着,如果你不知道它,说明暂时对你还不重要,可以先不管,优先去解决那些你接触到的输出文件。
5)在后面的几个小节中,我们会介绍几个常用的输出文件,大家学习一番,对于其他的,照猫画虎就可以了。
6)网上有很多的脚本用来分析这些输出文件,大师兄最推荐的有3个:ASE, Pymatgen, VTST.
7)学会使用Chatgpt或者Deepseek等AI tools,让它们帮我们写一些调用ASE和Pymatgen的小脚本去分析这些输出结果,会让你的工作效率极大地提升,但是你需要去浏览ASE 和 Pymatgen 的官网,知道这两个软件都是干嘛用的。
8)可视化的软件也有很多:ASE的GUI, VESTA, Material Studio, Gaussian View等。大师兄最推荐的是p4vasp,ASE,和 VESTA。 p4vasp需要参考: Ex1.1 学习VASP的硬件和软件要求。需要注意的是p4vasp没人更新了,这一条里面提到的,我感觉都必要都学会一些。
9) 其他的读取输出文件,去实现某一个功能的,可以去Github上搜搜,比如:cgrad. https://github.com/Ionizing/usefultools-for-vasp
10) 使用VASP做计算已经有很久的历史了,各种报错以及解决方案网上基本上到处都是。所以,如果你计算的时候遇到问题,首先要做的就是把心放在肚子里,然后悠闲的去Google或者用AI工具去搜索这些报错的提示信息,找到对应的解决办法。
11) 学会使用VIM,grep, sed 等一些常用的Terminal的命令去提取输出文件中的信息,当然也可以让AI去帮忙写一个Python或者Bash脚本。
12) 也可以加入我们的QQ群:217821116 或者 995178568 去交流学习。加群密码:bigbrosci
13) 总之一句话:输出文件就几何结构和电子结构这两个方面,学习和出现问题都有解决办法,什么都不用不愁,你需要做的事情就是耐心的去了解这些内容。